Rada Programowa pełni funkcję doradczą i opiniotwórczą. Jej członkowie nakreślają kierunki działalności i rozwoju Instytutu oraz oceniają realizację celów statutowych.
Skład osobowy Rady Programowej Instytutu Dialogu Międzykulturowego im. Jana Pawła IIw Krakowie
Kadencja 2019-2024
Przedstawiciele województwa małopolskiego
1. Witold Kozłowski – Marszałek Województwa Małopolskiego
2. Rafał Bochenek
3. Prof. Dr. Hab. Jan Tadeusz Duda
4. Wojciech Grzeszek
5. Urszula Nowogórska
6. Jacek Krupa
Przedstawiciele Gminy Kraków
7. Bogusław Kośmider- III zastępca Prezydenta Miasta Krakowa
8. Jerzy Muzyk – II zastępca Prezydenta Miasta Krakowa
9. Marta Nowak
10. Marta Witkowicz
11. Stanisław Dziedzic
12. Tadeusz Jakubowicz
Przedstawiciele Centrum Jana Pawła II „Nie lękajcie się!
13. Ks. Prof. Robert Tyrała
14. O. prof. Jarosław Kupczak
15. Ks. Prof. Jan Machniak
16. Ks. Robert Pietrzyk
17. Elżbieta Koterba
18. Barbara Dziwisz